El territorio Maya consistía en más de 300,000 km2, el cual estaba dividido en la región norte, región central y la región sur, todas estas regiones se extendían a lo largo de los estados de Chiapas, Tabasco, Campeche, Quintana Roo y Yucatán; también ocupaban parte de Belice, Honduras y El Salvador.
La región norte comprendía la península de Yucatán y la delimita al sur desde la Laguna de Términos en el sur de Campeche hasta la bahía de la Ascensión en el sur de Quintana roo. En esta región la porosidad del suelo explica que apenas haya corrientes o cuerpos de agua en la superficie, las llaves escurren a través de la roca caliza y se filtran hasta los mantos acuíferos impermeables, que forman una extensa red de corrientes subterráneas.
Con el tiempo los flujos de agua disuelven la roca caliza y esta forma grandes pozos naturales conocidos como cenotes, llamados en la lengua Maya Dzonot, estos cenotes tienen diámetros desde 10 hasta 100 metros, en el caso del cenote de Dzibilchaltún, ubicado en la zona de Chichén Itzá, tiene una profundidad de 20 metros.
La región norte también cuenta con el río Champotón y el río Lagartos, que mas bien es una ciénaga que desemboca al mar y el río Hondo que establece el límite entre Quintana Roo y Belice.
También podemos encontrar en lago de Bacalar con una extensión aproximada de 50 km. Y 10 km de ancho, las lagunas que se encuentran en esta región son:
- Laguna Coba
- Laguna Macanxoc
- Laguna Xcanhá
- Yax-Laguna

Coba
La región central se situaba en la zona de Chiapas, Tabasco, sur de Campeche y Quintana Roo, el norte de Guatemala y Belice, incluyendo el occidente de honduras, toda esta zona estaban a 150-300 metros sobre el nivel del mar.
En esta región podemos encontrar ríos y lagos como son:
Ríos
- Río Grijalva
- Río Golfete
- Río Dulce
- Río Motagua
- Río Usumacinta
- Río Salinas o Chixoy
- Río La Pasión
- Río Lacantún
- Río Candelaria
Lagos
- Lago Petén Itzá
- Lago Izabal
Por sus características climáticas existen arboles de gran valor humano, por sus duras maderas o por su significado simbólico, como es el caso de la ceiba, que para los mayas es el árbol sagrado, porque consideraban que en una ceiba enorme estaba el centro del universo, sosteniendo con su copa los cielos y sus raíces penetran en lo más profundo de la tierra. Este árbol sagrado era llamado Yaxché, pudiendo alcanzar los 70 metros de alto.
Pudiendo encontrar el chicozapote, muy importante por sus frutos y dura madera, con el que se hacían los dinteles tallados de muchos edificios mayas, también encontramos caoba, cedro, hule, sombrerete, mamey, palo mulato, amates, higueras y guapaque.
Y el producto más importante para preparar una bebida refrescante y obtener el chocolate, que es el cacao, esta región tiene una diversidad vegetal tan grande que en una sola hectárea podemos encontrar 267 tipos de plantas, entre la especies animales se encuentran el venado, pecarí o jabalí, jaguar, ocelote, tapir, saraguatos o monos aulladores y monos araña, tepezcuintle, armadillo y varias clases de serpientes.
En la selva podemos encontrar una variedad de aves de plumajes policromos, como los tucanes, guacamayas, la perdiz, el hocofaisán, palomas, águila arpía, también encontramos caimanes, cocodrilos, nutrias y manatí
La región sur comprende las tierras altas de Chiapas, Guatemala y El Salvador, así como la llanura costera del pacifico, esta zona está formada por sierras y valles intermontanos de origen volcánico con alturas superiores a los 1000 metros sobre el nivel del mar.
Esta es una zona volcánica donde se encuentran 12 grandes volcanes entre ellos tenemos:
- Volcán Chichonal
- Volcán Tacaná
- Volcán Tajumulco
- Volcán Atitlán
- Volcán de Agua
- Volcán de Fuego

Volcan Chichonal
Existen 2 lagos importantes que son:
- El lago Atitlán que se ubica a 75 km al oriente de la capital de Guatemala y está rodeado por volcanes, entre ellos el volcán Atitlán de 3,596 de metros de altura.
- El lago Amatitlán se localiza a unos 25 km hacia el sur de la capital de Guatemala.
- En esta región existen abundantes recursos minerales, como los yacimientos de obsidiana, que se ubican los más importantes en Ixtepeque y el Chayal en Guatemala, los mayas utilizaron la obsidiana para construir diversos instrumentos como cuchillos, navajas, puntas de lanza, espejos y ornamentos diversos.
- Los mayas obtenían la hematita, que es un pigmento natural rojo empleado en la pintura de edificios hasta la decoración de vasijas o textiles; también se extraían piedras semipreciosas como la serpentina y la jadeíta, que es una variedad del jade, esta última se encontró un yacimiento en la cuenca del río Motoagua.
- Los mayas consideraban al Quetzal, un ave sagrada que habitaba en las tierras altas. Sus plumas verdes doradas eran el símbolo del dios celeste y la plumas con más de 70 cm de largo eran utilizadas como parte del atavío de los gobernantes.